一、在尋找疾病靶點方面，drugbank和TTD等數據庫的區別
1、數據來源不同
DrugBank主要以已經上市的藥物為主，其數據來源包括FDA批準的藥物、文獻、專利和非專利報道等。TTD則是基于公開的文獻、專利、臨床試驗等多種來源整理而成。
2、數據內容不同
DrugBank提供的信息更為全面，包括藥物的化學結構、藥理學特征、轉運蛋白相關信息、藥物副作用等方面。而TTD則主要提供靶點的信息，包括其結構、功能、通路以及小分子化合物對其的調控作用等方面。
3、數據組織形式不同
DrugBank在數據庫的構建和管理中采用了關系型數據庫的方法，可以通過類似SQL查詢語句來查詢數據。而TTD則主要采用基于網絡的圖形顯示方式來展示靶點的信息。
二、常用藥物靶點搜索查詢的數據庫
1、DrugBank
DrugBank數據庫是阿爾伯塔大學將詳細的藥物數據和全面的藥物目標信息結合起來，結果都是有實驗驗證過的，真實可靠的生物信息學和化學信息學數據庫。
DrugBank的角色主要有兩個：
臨床導向的藥品百科全書：DrugBank能夠提供關于藥品，藥品靶點和藥物作用的生物或生理結果的詳細、最新、定量分析或分子量的信息。化學導向的藥品數據庫：DrugBank能夠提供許多內置的工具，用于查看、排序、搜索和提取文本、圖像、序列或結構數據。自數據庫首次發布信息起，DrugBank已被廣泛應用于計算機檢索藥物、藥物“復原”、計算機檢索藥物結構數據、藥物對接或篩選、藥物代謝預測、藥物靶點預測和一般制藥教育。DrugBank包含13791種藥物條目，其中包括2653種經批準的小分子藥物、1417種經批準的生物技術(蛋白質/肽)藥物、131種營養品和6451種實驗藥物。此外，5236個非冗余蛋白(即藥物靶標/酶/轉運體/載體)序列與這些藥物條目相關聯。每個DrugCard條目包含200多個數據字段，其中一半用于藥物/化學數據，另一半用于藥物靶標或蛋白質數據。DrugBank最大的特色是它支持全面而復雜的搜索，結合DrugBank可視化軟件，這些工具能讓科學家們非常容易的檢索到新的藥物靶目標、比較藥物結構、研究藥物機制以及探索新型藥物。
2、Therapeutic Target Database
Therapeutic Target Database (以下簡稱TTD) 是全球名列前茅個提供免費藥物靶標信息的在線數據庫，是藥物靶標發現和新藥開發領域具有國際影響力的數據平臺。該數據平臺的年訪問量超過15萬人次，總訪問量達240余萬人次，年平均被引次數超過200次。隨著精準醫療的發展和AI技術的突破，TTD數據庫的構建部分滿足了相關AI研究的數據需求，為藥物設計與新藥發現提供了不可或缺的重要支持。目前，該數據庫收錄了3500余個藥物靶點，近4萬個藥物分子。
TTD數據庫針對藥靶信息定義不嚴格這一爭議問題，提出了一套基于“藥、靶、病”三者關聯的藥靶確定策略。運用這一策略，TTD嚴格確證了所有美國FDA已批準藥物（2000余個）和臨床試驗藥物（9400余個）的主要療效藥靶，嚴格區分了“無療效”和“有療效”藥靶的概念，最終發現目前所有FDA已批準藥物僅作用于近500個療效藥靶。同時，為了推動COVID-19新藥開發，TTD整理了目前正在臨床和臨床前研究的候選藥物信息，嚴格確定了每種藥物的主要療效藥靶，提供了214個獨立藥物分子實體信息。藥靶確定研究發現，這些藥物作用于53個藥靶上，為抗新冠藥物設計、發現和測試提供了嚴格的藥靶信息。
基于嚴格確定的療效藥靶信息，TTD數據庫還發展了一系列輔助藥靶發現的新功能，為彌合藥靶數據與新藥靶發現之間的鴻溝，提出了創新性的解決方案。這些新功能包括：藥靶差異表達分析和突變識別，藥靶調節因子發現和信號通路分析、藥物藥靶的相似性搜索等。嚴格確定的藥靶數據與構建的新型藥靶發現工具之間，相輔相成、互為依托，為當前藥靶發現研究打下了堅實的數據和工具基礎。
3、PubChem
PubChem，有機小分子生物活性數據，是一個生環化材中應用分子的數據模型庫，它是由美國國家健康研究院支持，美國國家生物技術信息中心（NCBI）負責維護的一款實用查詢網站。
PubChem里面包含了大量分子材料的理化性能介紹，而且對應每個有機分子的應用都能夠追根溯源到較為全面的文獻報道，生物醫藥和生化交叉領域的科研人員尤為青睞。我們可以按名稱，分子式，結構和其他標識符搜索化學物質來查找化學和物理性質，生物活性，安全性和毒性信息，專利，文獻引用等等。可供檢索的化合物有11100萬種，物質28700萬種，生物活性27300萬種、相關文獻3200萬篇、專利250萬種。
PubChem數據庫包括3個子數據庫（可集成在一起檢索，也可以單獨檢索）：
PubChem BioAssay (化合物)–用于存儲生化實驗數據，實驗數據主要來自高通量篩選實驗和科技文獻；PubChem Compound (物質) –用于存儲整理后的化合物化學結構信息；PubChem Substance (生物檢測劑)–用于存儲機構和個人上傳的化合物原始數據。4、ChEMBL
ChEMBL數據庫是歐洲生物信息研究所（European Bioinformatics Institute，EBI）開發的一個靶點與生物活性藥物數據庫，收集的是藥物研究和開發過程中的藥物化學數據和知識，比如臨床實驗藥物和批準藥物的治療靶標和適應癥，旨為藥物化學家們提供一個非常便利的查詢靶點或化合物的生物活性數據的平臺。截至2019年10月29日，該數據庫共收集了12482個靶點，1,961,462個不同的化合物和13,382個靶點信息。
ChEMBL數據庫信息統計：
ChEMBL也有一些小分子及其生物活性的信息，它們來自核心藥物化學期刊的全文文章，并與已批準的藥物和臨床開發候選藥物的數據(如作用機制和治療適應癥)相結合，做到權威與實用的完美結合。
延伸閱讀1：靶點是什么
靶點是與藥物特異性結合的生物大分子的統稱。靶點的種類主要有受體、酶、離子通道和核酸，存在于機體靶器官細胞膜上或細胞質內。迄今為止所發現的藥物作用靶點總數約為500個左右，其中還不包括抗菌、抗病毒等作用靶點，其中受體尤其是G蛋白偶聯受體靶點占據絕大多數。
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